Kościół Najświętszej Maryi Panny z Lourdes został wybudowany w latach 1892-1894 w stylu neoromańskim i neogotyckim według projektu Stefana Żołdaniego. Wraz z budową świątyni zadecydowano o stworzeniu nowego domu dla zakonników. Wynikało to z faktu, że Zgromadzenie Księży Misjonarzy potrzebowało więcej miejsca dla nowych seminarzystów. W ołtarzu głównym trójnawowego kościoła zobaczymy figurę Matki Boskiej z Lourdes przywiezioną pod koniec XIX wieku z Francji. W prawej nawie znajdziemy relikwie krwi świętego Jana Pawła II. W kruchcie umieszczono liczne tablice poświęcone m.in. oficerom polskim rozstrzelanym w Katyniu czy Romanowi Dmowskiemu. U szczytu każdej nawy wymalowany został awers i rewers medalika z objawienia Matki Boskiej w Paryżu św. Katarzynie Laubouré w 1830 roku. Znajduje się na nim modlitwa O Maryjo, bez grzechu poczęta, módl się za nami, którzy się do Ciebie uciekamy.
Park przed kościołem zorganizowano po II wojnie światowej na terenie dawnych ogrodów misjonarskich i parafialnych. Jego patronem od lat 90. XX wieku jest francuski ksiądz, założyciel Zgromadzenia Księży Misjonarzy, któremu w centralnej części parku poświęcono także pomnik. Przy parafii od ponad 60 lat z dużym rozmachem działa Duszpasterstwo Akademickie „Na Miasteczku”.
W 1929 roku obok kościoła otwarto szpital sióstr miłosierdzia, który działa do dziś jako szpital MSWiA w Krakowie.
